| No. | Unidad de investigación | Acrónimo | Enlace | Institución |
| 1 | Instituto de Investigaciones Agronómicas y ambientales | IIA | http://iia.fausac.gt/investigacion/ | Facultad de Agronomía |
| 2 | Dirección de Investigación de la Facultad de Arquitectura | DIFA | https://farusac.edu.gt/investigacion/programas-de-investigacion/ | Facultad de Arquitectura |
| 3 | Instituto de Investigaciones Económicas y Sociales | IIES | https://iies.usac.edu.gt/ | Facultad de Ciencias Económicas |
| 4 | Instituto de Investigaciones Jurídicas Sociales | IIJS | https://investigaciones.derecho.usac.edu.gt/ | Facultad de Ciencias Jurídicas y Sociales |
| 5 | Dirección de Investigación | https://medicina.usac.edu.gt/dinv.php | Facultad de Ciencias Médicas | |
| 6 | Instituto de Investigaciones Químicas y Biológicas | IIQB | https://iiqb-ccqqfar.usac.edu.gt/ | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacia |
| 7 | Instituto de Investigaciones Humanísticas | IIH | https://humanidades.usac.edu.gt/usac/institutos/instituto-de-investigaciones-humanisticas/ | Facultad de Humanidades |
| 8 | Centro de Investigaciones de Ingeniería | CII | https://portal.ingenieria.usac.edu.gt/cii | Facultad de Ingeniería |
| 9 | Instituto de Investigación en Ciencia Animal y Ecosalud | IICAE | https://www.facebook.com/pg/Instituto-de-Investigaci%C3%B3n-en-Ciencia-Animal-y-Ecosalud-656165867885574/posts/ | Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia |
| 10 | Departamento de Educación Odontológica | DEO | https://revistacientifica.postgradosodontologia.edu.gt/ | Facultad de Odontología |
| No. | Unidad de investigación | Acrónimo | Enlace | Institución |
| 11 | Instituto de Investigaciones Lingûísticas | Escuela de Ciencias Lingüísticas -CALUSAC- | ||
| 12 | Instituto de Investigaciones Políticas y Sociales | IIPS | https://iips.usac.edu.gt | Escuela de Ciencia Política |
| 13 | Centro de Estudios en Comunicología | CIIC | Escuela de Ciencias de la Comunicación | |
| 14 | Instituto de Investigación de Ciencias Físicas y Matemáticas | IFIM | https://ecfm.usac.edu.gt/index.php/node/54 | Escuela de Ciencias Físicas y Matemáticas -ECFM- |
| 15 | Escuela de Ciencias Psicológicas | CIEPS | http://cieps.usac.edu.gt/?page_id=7 | Escuela de Ciencias Psicológicas |
| 16 | Unidad de Investigación de la EFPEM | Escuela de Formación de Profesores de Enseñanza Media -EFPEM- | ||
| 17 | Escuela de Historia | IIHAA | http://iihaa.usac.edu.gt/ | Escuela de Historia |
| 18 | Instituto de Investigaciones de la Escuela de Trabajo Social | IIETS | https://trabajosocial.usac.edu.gt/?page_id=161 | Escuela de Trabajo Social |
| 19 | Instituto de Investigaciones Estéticas y Creación | IIECRE | https://escuelasuperiordearte.usac.edu.gt/iiecre/ | Escuela Superior de Arte (Esarte) |
| No. | Unidad de investigación | Acrónimo | Enlace | Institución |
| 20 | Instituto de Investigaciones Hidrobiológicas | IIH | http://cema.usac.edu.gt/index.php/instituto-de-investigaciones-hidrobiologicas/ | Centro de Estudios del Mar y Acuicultura CEMA |
| 21 | Centro Universitario de Baja Verapaz (Cunbav) | Cunbav | https://cunbav.usac.edu.gt/ | Centro Universitario de Baja Verapaz |
| 22 | Instituto de investigación del Cundech | IICUNDECH | https://cundech.usac.edu.gt/ | Centro Universitario de Chimaltenango |
| 23 | Instituto de Investigaciones del Cunprogreso | Centro Universitario de El Progreso | ||
| 24 | Instituto de Investigaciones del Caribe de Izabal | IICI | https://cunizab.edu.gt/ | Centro Universitario de Izabal -CUNIZAB- |
| 25 | Instituto de Investigaciones del Jusac (Injusac) | INJUSAC | http://jusac.usac.edu.gt/ | Centro Universitario de Jutiapa -JUSAC- |
| 26 | Instituto de Investigación de Noroccidente | https://sites.google.com/cunoroc.edu.gt/iidenoc/inicio | Centro Universitario de Nor Occidente -CUNOROC- Huehuetenango | |
| 27 | Dirección General del Sistema de Investigación CUNOC | DICUNOC | http://dicunoc.cunoc.edu.gt/ | Centro Universitario de Occidente -CUNOC- Quetzaltenango |
| 28 | Instituto de Investigación de Oriente | IICUNORI | https://iic.ingsistemascunori.org/ | Centro Universitario de Oriente -CUNORI- Chiquimula |
| 29 | Coordinación de Investigación | ICC | https://cusacq.usac.edu.gt/?cat=16 | Centro Universitario de Quiche -CUSACQ- |
| 30 | Instituto de Investigación en Seguridad Alimentaria y Nutricional | IISAN | – | Centro Universitario de Retalhuleu (CUNREU) |
| 31 | Coordinación de Investigación del Cunsac | CDI | https://cunsac.usac.edu.gt/investigacion/ | Centro Universitario de Sacatepéquez (Cunsac) |
| 32 | Instituto de Investigaciones del CUSAM | IDICUSAM | http://investigacion.cusam.edu.gt/ | Centro Universitario de San Marcos -CUSAM- |
| 33 | Centro Universitario de Santa Rosa -CUNSARO- | – | Centro Universitario de Santa Rosa -CUNSARO- | |
| 34 | Departamento de Investigaciones Generales del Cunsol | Dicunsol | – | Centro Universitario de Solola (Cunsol) |
| 35 | Instituto de Investigación y Desarrollo del Suroccidente | IIDESO | – | Centro Universitario de Sur Occidente -CUNSUROC- Mazatenango |
| 36 | Departamento de Investigación de Sur Oriente | DISO | Centro Universitario de Sur Oriente -CUNSURORI- Jalapa | |
| 37 | Instituto de Investigación y Postgrado de Cuntoto | IIP-CUNTOTO | http://cuntoto.usac.edu.gt/mision-y-vision-iip/ | Centro Universitario de Totonicapán -CUNTOTO- |
| 38 | Instituto de Investigaciones del Cunzac | IICUNZAC | https://www.facebook.com/IICUNZAC/ | Centro Universitario de Zacapa -CUNZAC- |
| 39 | Centro Universitario del Norte -CUNOR- Cobán | IICUNOR | Centro Universitario del Norte -CUNOR- Cobán | |
| 40 | Instituto de Investigaciones del Cudep | IICUDEP | Centro Universitario del Petén -CUDEP- | |
| 41 | Instituto de Investigaciones del Cunsur | IICUNSUR | https://www.facebook.com/IICUNSUR | Centro Universitario del Sur -CUNSUR- Escuintla |
| No. | Unidad de investigación | Acrónimo | Enlace | Institución |
| 42 | Centro de Estudios de las Culturas en Guatemala (Ceceg) | Ceceg | http://ceceg.usac.edu.gt/ | Dirección General de Investigación -DIGI- |
| 43 | Centro de Estudios Urbanos y Regionales | CEUR | http://ceur.usac.edu.gt/investigaciones.html | Centro de Estudios Urbanos y Regionales -CEUR- |
| 44 | Centro de investigación Tecnológica del Sur | CIT/USAC-SUR | https://tecnologico.usac.edu.gt/?page_id=7 | Instituto Tecnológico Universitario Guatemala Sur (Itugs) |
| 45 | División de Desarrollo Académico | DI-DDA | https://diged.usac.edu.gt/dda/investigacion/ | División de Desarrollo Académico -DDA- |
| 46 | Instituto de Estudios Interétnicos y de los Puebos Indigenas | IDEIPI | https://ideipi.usac.edu.gt/ | Dirección General de Investigación -DIGI- |
| 47 | Instituto Tecnológico Maya de Estudios Superiores | https://itmes.edu.gt/ | Instituto Tecnológico Maya de Estudios Superiores (Itmes) | |
| 48 | Instituto de Análisis e Investigación de los Problemas Nacionales -IPNUSAC- | IPNUSAC | www.ipn.usac.edu.gt | Instituto de Análisis e Investigación de los Problemas Nacionales -IPNUSAC- |
| 49 | Instituto Universitario de la Mujer, Universidad de San Carlos de Guatemala. -IUMUSAC- | IUMUSAC | http://iumusac.usac.edu.gt/?page_id=745 | Instituto Universitario de la Mujer, Universidad de San Carlos de Guatemala. -IUMUSAC- |
| 50 | Laboratorio de Innovación. Fab-Lab USAC | Fab-Lab | https://www.facebook.com/FabLabUSAC | Dirección General de Investigación -DIGI- |